גובה שכר הלימוד שווה לגובה שכר לימוד אוניברסיטאי לכל שנת לימודים. שכר הלימוד צמוד למדד. 12,016 ₪ נכון לשנה"ל תשפ"ו.
ניתן לפצל שנת לימודים לשנתיים רצופות ללא תוספת תשלום על פי בקשה בכתב ובאישור המכללה.
אגרת ספרייה, אגרת שמירה, הסעות וארוחות יחויבו בכל שנה. כל פיצול אחר יחויב בתשלום נוסף לפי ש"ש (570 ₪ עבור כל 1 ש"ש נכון לשנה"ל תשפ"ו).
קורסים עודפים
בכל שנה ניתן ללמוד קורס נוסף, מעבר לחובות הלימודיים, ללא תוספת תשלום.
הלומדים קורסים או המשתתפים בסיורים מעבר לכך – יחויבו ב־510 ₪ לשיעור וב־150 ₪ ליום סיור.
הכרה בקורסי מכללת הרצוג מן העבר
ניתן לזכות תלמיד בתשלום – כגון מי ששילם על קורסים בודדים (למשל תלמיד שלא מן המניין) ואחר כך עבר ללימודים סדירים בתשלום מלא – אלא שהזיכוי הכספי על קורסים קודמים יינתן רק על קורסים שנלמדו בשנה הסמוכה לשנת הלימודים.